Three Sisters es un juego de rol y escritura estratégico sobre la agricultura de traspatio. El nombre de Three Sisters se debe a una técnica agrícola indígena que todavía se utiliza mucho en la actualidad y en la que se plantan tres cultivos diferentes -en este caso, calabazas, maíz y judías- muy juntos. El maíz proporciona un entramado para que los frijoles trepen, los frijoles aportan nitrógeno del aire a la tierra, y la calabaza proporciona una cobertura natural del suelo para reducir las malas hierbas y mantener alejadas las plagas.

En el juego, tienes tu propia hoja de jugador con múltiples áreas: el jardín, que se divide en seis zonas numeradas, cada una de las cuales contiene los tres tipos de cultivo; el colmenar; el abono; las plantas perennes; las mercancías; las frutas; y el cobertizo, que está lleno de herramientas que tienen habilidades especiales. Todos los cultivos, frutos, flores y colmenas están representados por pistas que irás marcando a medida que vayas adquiriendo estos elementos. Muchas de las pistas están interconectadas con otros elementos del juego, lo que te proporciona bonificaciones en el camino. Una característica común de estas pistas son los círculos que representan una cosecha, que genera bienes; si consigues suficientes bienes, desbloquearás acciones de bonificación. Avanzar en todas estas pistas ofrece diversas cantidades de puntos, avances y bonificaciones.

El juego dura ocho rondas. En cada ronda, se tiran los dados en función del número de jugadores, se agrupan por número y se colocan en un espacio de acción de la rueda de acción circular, empezando por la posición actual del granjero; el granjero se mueve en cada ronda, lo que significa que los dados que muestran 1s, 2s, etc. acabarán en espacios diferentes cada ronda. Una vez colocados los dados, cada jugador tira un dado y lo utiliza como se describe a continuación. Una vez que todos los jugadores han cogido un dado, todos los jugadores pueden utilizar el dado de menor valor que quede en la rueda de acción. Un dado te permite hacer dos cosas, que puedes hacer en cualquier orden:

Plantar o regar la zona numerada que coincida con el valor del dado.

Realizar la acción del espacio del que has retirado el dado.

Para plantar, marcas el espacio inferior de dos pistas de cultivo vacías. (Ten en cuenta que no puedes plantar judías hasta que el maíz adyacente a las judías sea lo suficientemente alto como para soportarlas). Para regar, marcas un espacio en todas las pistas de cultivo que ya tengan al menos una marca. En cuanto a las acciones de la rueda de acción, puedes

Plantar o regar de nuevo en la misma zona numerada.

Ganar un abono (que te permite ajustar los valores de los dados) y cuatro bienes (que te darán bonificaciones en el mercado agrícola).

Marcar la pista de la colmena, que puede darte puntos, bienes o acciones de bonificación.

Marca una de las cuatro pistas de fruta. Cada fruta vale diferentes puntos y diferentes cantidades de bienes y tiene diferentes longitudes de pista y posiciones de círculo.

Visita el mercado del agricultor, que te da puntos y bonificaciones según el número de bienes que hayas recogido.

Marca una de las quince pistas de herramientas en tu cobertizo. En cuanto completes una pista, ganarás ese poder u oportunidad de puntuación al final del juego.

Las perennes no tienen una acción directa asociada a ellas y se marcan sólo a través de acciones en otras áreas, con las diversas perennes dando diferentes bonificaciones a medida que las marcas.

Al final de la ronda, todos los jugadores reciben una acción de bonificación, ya sea una lluvia que riegue todas las zonas numeradas de tu jardín, un viaje al cobertizo o una visita al mercado del agricultor. Después de ocho rondas, se obtienen puntos por los cultivos cosechados, las plantas perennes, el colmenar, la fruta y algunos objetos del cobertizo. Quien tenga más puntos gana.

Three Sisters tiene un modo en solitario en el que intentas superar tu propia puntuación contra un "oponente" que tira dados y bloquea zonas de tu hoja.