Ubongo Junior toma el conocido juego de colocación de baldosas y emparejamiento de patrones de Ubongo y lo reduce para un público más joven.
En Ubongo Junior, cada jugador comienza el juego con nueve fichas -cada una de un color y forma diferentes, y cada una mostrando un animal- junto con una pila de siete tableros de rompecabezas. Los tableros de rompecabezas muestran una disposición de casillas que pueden cubrirse con dos fichas (en el lado fácil) o con tres (en el lado difícil); las fichas a utilizar están representadas en el tablero.
Al comienzo de cada ronda, cada jugador revela su tablero, encuentra las fichas necesarias y corre a colocarlas adecuadamente. La primera jugadora que lo hace lanza un reloj de arena y luego coge gemas de una bolsa, de 2 a 4 según el número de jugadores de la partida. La siguiente jugadora que complete su puzzle a tiempo coge una gema menos, y así sucesivamente.
El jugador que haya acumulado más gemas después de siete rondas gana.