Diseñar un "zoo maravilloso" no es tan fácil como parece. Primero hay que elegir un tema, luego encontrar los animales más bonitos y, por último, atraer a multitudes de visitantes entusiastas.
En WonderZoo, lo haces eligiendo en cada ronda una ficha de entre las que hay en la mesa y colocándola en tu tablero personal, con caminos que deben continuar de una ficha a la siguiente. También puedes llevar a cabo la acción indicada en la ficha que acabas de añadir, como añadir un visitante a tu zoo, mover un visitante, mover un recinto o convertirte en el primer jugador de la siguiente ronda.
Cuando no puedas colocar más fichas en tu zoo, la partida termina para ti, pero los demás jugadores podrán continuar dependiendo del estado de su zoo. Una vez que todos hayan completado sus zoológicos, los jugadores se anotan 1 punto por cada visitante junto a una ficha de recinto, y gana quien tenga más puntos.
Puedes aumentar el nivel de dificultad de WonderZoo haciendo que los jugadores empiecen con ciertas casillas bloqueadas, y también puedes añadir reglas de puntuación avanzadas, con el visitante amarillo otorgando 2 puntos cuando esté junto a un recinto amarillo.