Yōkai Quest es un juego de mesa colaborativo, fuertemente basado en las mecánicas clásicas de los juegos beat'em up y los RPG. Ambientado en un mundo de fantasía inspirado en Japón, las miniaturas incluidas están diseñadas con aspecto "chibi"; esto significa una forma de diseño simpática, con los personajes de caras grandes y expresivas.

Los jugadores pueden elegir entre diferentes héroes: un samurái, un monje, un pistolero, un sacerdote y otros. Cada uno de ellos tiene un conjunto único de rasgos: movimiento, poder de ataque, habilidades, etc. Al principio de la partida, el jugador configurará las habilidades que el héroe podrá utilizar durante el combate: estas habilidades harán que el héroe sea más defensivo, que pueda ayudar a otros héroes y/o que tenga acceso a poderosos ataques.

Los Yōkai son los enemigos del juego: inspirados en los del folclore japonés, estos seres sobrenaturales seguirán "cartas de comportamiento", por lo que su actuación es gestionada por los propios jugadores. Éstas indicarán de forma sencilla qué harán los Yōkai en cada situación. Los Yōkai surgirán constantemente de puntos establecidos en cantidades aleatorias, que se decidirán robando cartas de su mazo específico.

Los héroes y los Yōkai juegan por turnos: se moverán, atacarán y utilizarán habilidades mientras luchan en los tableros de baldosas. La jugabilidad tiene una sensación de puesta en escena, representada por los diferentes escenarios. Para avanzar, hay que cumplir objetivos: eliminar a un número determinado de enemigos, sobrevivir el tiempo suficiente, etc. Así hasta que los héroes llegan al último tablero, donde aparece el jefe final de la misión. Para ganar la misión, los héroes deben derrotar a este poderoso enemigo.